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一种适用于CRISPR/Cas9系统的基因组DNA片段编辑精准度的分析方法及应用

本发明属于生物技术领域,具体涉及一种适用于CRISPR/Cas9系统的基因组DNA片段编辑精准度的分析方法及其应用。本发明所述分析方法将Cas9核酸酶对基因组DNA双链进行切割的方式区分为钝末端切割与突出末端切割,钝末端切割方式对应的切割末端占比为钝断裂末端占比,突出末端切割方式对应的切割末端占比为突出断裂末端占比,通过预测候选sgRNA组合在每种切割方式下对应的断裂末端序列,并结合所述钝断裂末端占比与突出断裂末端占比,来预测采用候选sgRNA组合及选用的Cas9核酸酶对基因组DNA片段编辑的精准度。采用所述分析法可先对编辑方法进行精准度预测,能够略去繁杂的实验,从而提高实验效率。
上海交通大学
吴强 | 李金环 | 寿佳

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