本发明公开了基于迁移学习的分布式转录调控网络大模型构建方法,以有文献支撑的可靠转录调控先验关系作为分布式子网络输入变量和输出变量的选择依据,利用迁移学习思想进行模型训练,以获取转录过程中的调控关系,包括以下步骤:步骤S1,通过转录调控先验知识获取转录调控关系;步骤S2,构建分布式转录调控网络大模型;步骤S3,在泛转录组数据上进行模型预训练;步骤S4,采用时序数据集,对模型进行微调以得到特异性分布式大模型;步骤S5,根据数据特征制定预测结果的评价指标。采用本方法,可以实现转录调控关系方向的预测,进一步指导靶基因表达水平的调控,加快转录调控关系的相关研究。
上海交通大学 | 华东理工大学
鲁洪中 | 颜学峰 | 范星存 | 曹凌峰 | 廖文彬
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