一种药物分子与靶标蛋白的结合亲和力预测方法

本发明涉及一种药物分子与靶标蛋白的结合亲和力预测方法，包括：获取药物分子的SMILES序列和靶标蛋白的氨基酸序列；对于药物分子SMILES序列，将其表示为基于原子的药物原子结构图和基于子结构的药物子结构结构图；分别对药物原子结构图和药物子结构结构图进行表征学习，从而获得药物原子结构图的特征嵌入表示和药物子结构结构图的特征嵌入表示；获取氨基酸序列的特征嵌入表示；将药物分子和氨基酸的特征嵌入表示拼接，得到拼接嵌入特征表示；基于拼接嵌入表示，获得药物分子与靶标蛋白的结合亲和力预测值。上述方案，能够自适应的学习药物分子和靶标蛋白的序列和结构信息，优化药物分子与靶标蛋白的结合亲和力预测结果。