精确测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法

本发明涉及精准测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法和由该方法得到的全基因组序列。该方法包括步骤：(1)提取中华绒螯蟹肌肉组织中的全基因组DNA，构建基因文库，利用第二代测序技术进行测序；(2)参考近缘物种线粒体全基因组序列对测序读段进行筛选，除去核DNA片段，然后进行线粒体基因组的拼接，再对拼接的线粒体基因组的编码蛋白基因、rRNA和tRNA进行预测注释；(3)将拼装好的线粒体基因组序列和近缘缘物种线粒体基因组序列比对，根据保守区，再参考所述近缘物种的线粒体全基因组序列设计引物，对对应的第二代测序样品进行PCR扩增，利用第一代测序技术测序PCR扩增产物，校正拼接的线粒体基因组序列。该方法具有快速、准确的优点。
上海海洋大学
吴旭干 | 张成 | 成永旭