本发明提供了一种基于数据驱动的新能源船舶节能减排方法及系统,包括:步骤S1:船载光伏发电系统和船载风力发电系统基于深度学习构建船载新能源发电数据驱动模型;步骤S2:基于深度学习网络构建船载新能源发电预测模型,船载新能源发电预测模型利用船载新能源发电数据驱动模型对船载新能源发电出力进行预测,得到预测信息;步骤S3:根据预测信息,利用智能优化算法,对船舶柴油发电机进行优化;本发明通过所提出的数据驱动模型,可以掌握船载新能源发电规律,对船载新能源发电进行有效预测,有助于船舶更好的利用新能源。